2002 yılında Gazi Üniversitesi Mühendislik Mimarlık Fakültesi, Mimarlık Bölümü'nden mezun oldu. Aynı yıl, Naturland EcoPark & Resort Hotels renovasyon projesinde proje sorumlusu olarak görev aldı.

2003-2005 yılları arasında CHP Genel Merkez binası dekorasyon projesi, Jale Tezer Anaokulu, Altındağ Belediyesi Kültür Merkezi, Türk Patent Enstitüsü Konferans Salonu ve çeşitli özel villa dekorasyon projelerinde tasarımcı mimar olarak görev aldı. 2006 yılında Antalya'da Orfe Atlıspor Klübü Binicilik, Konaklama ve Günübirlik tesisleri projesinde tasarımcı ve proje yürütücüsü olarak yer aldı.

2006 yılından bu yana ACE Mimarlık Mühendislik Müşavirlik Limited Şirketi'nde çalışan Nilgün Deniz, Tasarım Merkezi Koordinatörü / Mimar olarak faaliyetlerine devam ediyor.